Это озеро находится в окружении гор на высоте 1600 м над уровнем моря.
По своим размерам оно занимает 19-е место в мире. В Иссык-Куле воды почти вдвое больше, чем в Аральском море. Это четвертое по объему воды озеро планеты. Его глубина достигает иногда более 700 м. Среди внутренних водоемов страны только Байкал и Каспий глубже Иссык-Куля.
От любого из океанов Иссык-Куль удален на тысячи километров. Вокруг озера – пустыни. Широкой полосой протянулись они от Каспия до центрального Китая. В Иссык-Куль впадает более сотни речек, но из него не вытекает ни одного ручейка. Все примеси, которые попадают в озеро, остаются в нем.
Кроме того, уровень воды в озере неуклонно снижается, потому что оно находится в зоне недостаточного увлажнения и исключительно высокого уровня солнечной активности. Ясных дней здесь намного больше, чем на черноморских берегах. За последние сто лет уровень Иссык-Куля понизился почти на 7 м.